MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 6056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015183	GGT	2	6	2493828	2493833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_015183	ACC	2	6	2493881	2493886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_015183	GCC	2	6	2494098	2494103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NC_015183	TTCAG	2	10	2494116	2494125	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5505	NC_015183	CCCT	2	8	2494135	2494142	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5506	NC_015183	CGT	2	6	2494180	2494185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_015183	CAT	2	6	2494250	2494255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_015183	CTT	2	6	2494278	2494283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_015183	TC	3	6	2494326	2494331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_015183	ACC	2	6	2494356	2494361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_015183	CGC	2	6	2494415	2494420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_015183	ACA	2	6	2494443	2494448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_015183	ACC	2	6	2494465	2494470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_015183	TC	3	6	2494589	2494594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_015183	CAG	2	6	2494642	2494647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_015183	CTTT	2	8	2494798	2494805	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5517	NC_015183	ATG	2	6	2494808	2494813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_015183	GCT	2	6	2494814	2494819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_015183	GTT	2	6	2494837	2494842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_015183	GTT	2	6	2494904	2494909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_015183	ACG	2	6	2494919	2494924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_015183	GT	3	6	2494941	2494946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_015183	CTC	2	6	2494960	2494965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_015183	AACT	2	8	2495226	2495233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5525	NC_015183	TCG	2	6	2495394	2495399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_015183	TCA	2	6	2495591	2495596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_015183	TCGC	2	8	2495619	2495626	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_015183	ACT	2	6	2495628	2495633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_015183	CTT	2	6	2495696	2495701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_015183	CTT	2	6	2495870	2495875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_015183	CCA	2	6	2495897	2495902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_015183	CTT	2	6	2495918	2495923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_015183	ATC	2	6	2495994	2495999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_015183	TGA	2	6	2496003	2496008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_015183	ATC	2	6	2496091	2496096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_015183	CAA	3	9	2496155	2496163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_015183	TCCT	2	8	2496183	2496190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5538	NC_015183	CCA	2	6	2496204	2496209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_015183	TCT	2	6	2496303	2496308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_015183	TGG	2	6	2496510	2496515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_015183	TGG	2	6	2496645	2496650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_015183	ATCA	2	8	2496763	2496770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_015183	GAA	2	6	2496877	2496882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_015183	AGG	2	6	2497066	2497071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_015183	CCT	2	6	2497148	2497153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_015183	GT	3	6	2497207	2497212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_015183	GCA	2	6	2497237	2497242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_015183	CAC	2	6	2497358	2497363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_015183	GT	3	6	2497375	2497380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_015183	AGCCC	2	10	2497381	2497390	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5551	NC_015183	CACGA	2	10	2497526	2497535	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5552	NC_015183	GAC	2	6	2497539	2497544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_015183	GCA	2	6	2497551	2497556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_015183	GCC	2	6	2497873	2497878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_015183	TCC	2	6	2497893	2497898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_015183	AAC	2	6	2498053	2498058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_015183	GCT	2	6	2498083	2498088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_015183	CTT	2	6	2498108	2498113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_015183	TCT	2	6	2498132	2498137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_015183	TCA	2	6	2498169	2498174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_015183	CTG	2	6	2498226	2498231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_015183	ATC	2	6	2498276	2498281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_015183	TCG	2	6	2498301	2498306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_015183	CCA	2	6	2498325	2498330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_015183	TCA	2	6	2498352	2498357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_015183	GCC	2	6	2498506	2498511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_015183	CGTT	2	8	2498514	2498521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5568	NC_015183	CGA	2	6	2498587	2498592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_015183	CGC	2	6	2498711	2498716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_015183	TCTT	2	8	2498726	2498733	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5571	NC_015183	A	6	6	2498750	2498755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_015183	CAAAAG	2	12	2498789	2498800	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5573	NC_015183	ACA	2	6	2498811	2498816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_015183	TCA	2	6	2498827	2498832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_015183	TCG	2	6	2498859	2498864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_015183	CAG	2	6	2498866	2498871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_015183	CGC	3	9	2498872	2498880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5578	NC_015183	AC	3	6	2498928	2498933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_015183	A	6	6	2498942	2498947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_015183	AGGG	2	8	2499002	2499009	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_015183	CCT	2	6	2499019	2499024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5583	NC_015183	GAA	2	6	2500837	2500842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_015183	CATC	2	8	2500860	2500867	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_015183	CCG	2	6	2500890	2500895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_015183	GAA	2	6	2500937	2500942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_015183	GCT	2	6	2505325	2505330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5589	NC_015183	A	6	6	2506946	2506951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_015183	CGT	2	6	2507591	2507596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_015183	CCGGC	2	10	2507616	2507625	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5592	NC_015183	T	6	6	2507638	2507643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_015183	CG	3	6	2507667	2507672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5594	NC_015183	ATG	2	6	2507740	2507745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_015183	CAG	2	6	2507785	2507790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_015183	GAAAA	2	10	2507799	2507808	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_015183	A	6	6	2507805	2507810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_015183	C	6	6	2510014	2510019	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5599	NC_015183	TCA	2	6	2510025	2510030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_015183	TGG	2	6	2510074	2510079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_015183	GT	3	6	2510145	2510150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_015183	AT	3	6	2510160	2510165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_015183	GCT	2	6	2510228	2510233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_015183	ACA	2	6	2510278	2510283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_015183	GC	3	6	2510550	2510555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5606	NC_015183	GC	3	6	2510587	2510592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_015183	ACG	2	6	2510636	2510641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_015183	CTC	2	6	2510733	2510738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5609	NC_015183	CCCAG	2	10	2510765	2510774	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5610	NC_015183	CT	3	6	2510793	2510798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5611	NC_015183	CGC	2	6	2510799	2510804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5612	NC_015183	CG	3	6	2510810	2510815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_015183	TGG	2	6	2512201	2512206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_015183	GCC	2	6	2513509	2513514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5615	NC_015183	GGC	2	6	2513521	2513526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_015183	T	6	6	2513527	2513532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_015183	AT	3	6	2513544	2513549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_015183	AT	3	6	2513586	2513591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_015183	TCA	2	6	2513592	2513597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_015183	AC	3	6	2513618	2513623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5621	NC_015183	GA	3	6	2514452	2514457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_015183	CGC	2	6	2517655	2517660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5623	NC_015183	ATG	2	6	2521509	2521514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_015183	TGC	2	6	2521705	2521710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_015183	TGGC	2	8	2521714	2521721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5626	NC_015183	AAC	2	6	2521733	2521738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_015183	GTC	2	6	2529545	2529550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_015183	AGG	2	6	2529681	2529686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_015183	AAAT	2	8	2533028	2533035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_015183	AAATG	2	10	2533054	2533063	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_015183	CTGA	2	8	2533064	2533071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5764	NC_015183	TCC	2	6	2637687	2637692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5765	NC_015183	TTA	2	6	2637714	2637719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5766	NC_015183	ATCA	2	8	2637738	2637745	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5767	NC_015183	CAT	2	6	2639039	2639044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5772	NC_015183	CAA	2	6	2639980	2639985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5778	NC_015183	GGCG	2	8	2641909	2641916	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5779	NC_015183	TCA	2	6	2642641	2642646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5781	NC_015183	GCT	2	6	2645947	2645952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5798	NC_015183	GCCG	2	8	2651596	2651603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5825	NC_015183	TGG	2	6	2667968	2667973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5859	NC_015183	GGC	2	6	2687556	2687561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5862	NC_015183	GGGC	2	8	2693592	2693599	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5863	NC_015183	CTG	2	6	2697141	2697146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5881	NC_015183	TG	3	6	2709111	2709116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5885	NC_015183	A	6	6	2709515	2709520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5889	NC_015183	TGA	2	6	2710779	2710784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5890	NC_015183	GGA	2	6	2710794	2710799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5891	NC_015183	CCG	2	6	2710823	2710828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5892	NC_015183	TC	3	6	2710873	2710878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5893	NC_015183	TCCCT	2	10	2710952	2710961	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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